Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms