Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnajc28Q8VCE1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc28Q8VCE1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms