Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nae1Q8VBW6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms