Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q8R3C1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8R3C1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8R3C1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms