Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms