Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Hoxc12Q8K5B8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Hoxc12Q8K5B8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Hoxc12Q8K5B8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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