Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms