Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms