Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms