Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms