Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtmr3Q8K296 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mtmr3Q8K296 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mtmr3Q8K296 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mtmr3Q8K296 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mtmr3Q8K296 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mtmr3Q8K296 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mtmr3Q8K296 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mtmr3Q8K296 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mtmr3Q8K296 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mtmr3Q8K296 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms