Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gtf3c1Q8K284 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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Gtf3c1Q8K284 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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