Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Neil3Q8K203 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms