Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot3Q8K0V4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms