Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FgbQ8K0E8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FgbQ8K0E8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FgbQ8K0E8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FgbQ8K0E8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms