Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms