Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp1Q8K021 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms