Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms