Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms