Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms