Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Card11Q8CIS0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Card11Q8CIS0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms