Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgefQ8CHT1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms