Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms