Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec10Q8CF98 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms