Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Usp27Q8CEG8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Usp27Q8CEG8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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