Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc49a3Q8CE47 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc49a3Q8CE47 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms