Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms