Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms