Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubqln3Q8C5U9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms