Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms