Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q8C5C9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q8C5C9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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