Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccser1Q8C0C4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccser1Q8C0C4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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