Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms