Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms