Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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