Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms