Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms