Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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Usp38Q8BW70 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Usp38Q8BW70 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Usp38Q8BW70 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Usp38Q8BW70 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Usp38Q8BW70 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Usp38Q8BW70 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Usp38Q8BW70 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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