Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcl3Q8BVF2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms