Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms