Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BPC6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8BPC6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8BPC6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8BPC6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8BPC6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8BPC6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8BPC6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8BPC6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms