Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms