Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan12Q8BKT6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms