Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms