Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox2Q8BII1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms