Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms