Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms