Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8BGC1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms