Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms