Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms